Составной частью кафедры паразитологии и ВСЭ является паразитологический музей, который по количеству и разнообразию экспонатов представляет собой крупнейший музей Северо-Кавказского региона. Он создан основоположником кафедры паразитологии К.И. Скрябиным вместе с сотрудниками, студентами и ветврачами хозяйств в период с 1919 по 1920г. 

В музее собраны уникальные экспонаты и научные коллекции. Основой его явились паразитические черви от животных, птиц, амфибий и рыб, собранные в результате тридцати гельминтологических экспедиций по Северному Кавказу, в работе которых принимали активное участие профессора В.И. Пухов, П.А. Величкин, А.А. Лысенко, доцент Е.Е. Кривошта, ассистенты Н.П. Захаров, С.А. Ажинов и др. 

В пополнение музея свою лепту внесли профессор Н.Ф. Фирсов, доценты А.Н. Островский, В.С. Бартенев, Н.Н. Колыбельников, В.П. Кириченко, а также аспиранты, практические ветврачи, студенты, лаборанты. 

Музей располагается в отдельном зале площадью 80 м2. Экспозиционный материал и научные коллекции выставлены также в четырех классных комнатах, вестибюле, манеже и других помещениях. 

Основой экспозиции является 785 макропрепаратов, представляющих возбудителей гельминтозов и пораженные ими органы человека и животных – млекопитающих, птиц, рептилий, рыб, являющихся различными хозяевами паразитических червей. Имеются экспонаты, демонстрирующие вызываемые ими тяжелые и даже неизлечимые заболевания. 

Посетители могут увидеть инвазированные личинками и взрослыми гельминтами органы – головной мозг, глаза, легкие, сердце, печень, селезенка, почки, желудок, кишечник, мышцы, чешуя и плавники рыб. Экспонаты наглядно показывают результаты разрушительного действия гельминтов: атрофию тканей и органов, закупорку кишечника аскаридами и монезиями и др. Особый интерес представляют уникальные экспонаты – головной мозг и печень человека, пораженные эхинококовыми пузырями, цепни и лентецы людей. 

В коллекции музейных препаратов имеются различные насекомые, клещи, моллюски, ракообразные, которые являются переносчиками ряда болезней и нередко сами вызывают тяжелую патологию организма. 

В музее располагаются стенды с оригинальными фотографиями, макеты органов, альбомы, приборы, рабочий стол академика К.И. Скрябина с канцелярскими принадлежностями, научная библиотека профессора А.А. Лысенко. 

Музей является неотъемлемой частью учебного процесса, здесь студенты и аспиранты детально знакомятся с возбудителями паразитарных болезней и вызываемыми ими патологиями. 

Частые посетители музея – школьники и учащиеся сельскохозяйственных колледжей. Музей нередко посещают многочисленные делегации гостей – ученых и специалистов высшей школы. 

Имеющиеся экспонаты и иллюстративные материалы дают возможность наглядно ознакомиться с формированием и развитием паразитологической науки в нашем регионе.