В вузе разработана комплексная программа «Будущее университета». В ее рамках аспиранты получают первоочередной доступ к высокотехнологичным приборам и оборудованию, право бесплатных публикаций в «Вестнике Донского ГАУ», который входит в систему РИНЦ. Кроме того, молодые ученые имеют возможность повышать квалификацию в ведущих отечественных научных центрах, а в случае приоритетности направления исследований – создания под их руководством научных школ и исследовательских лабораторий.

Количество направлений, по которым в университете ведется подготовка аспирантов – 13, направленностей – 20.